新世纪淫魔圣伝第三章在末世般的未来世界中展开，主角在探索禁忌力量的过程中逐步揭开隐藏在世界背后的淫魔传说与古老预言。第三章承接前两章剧情，深入描绘主角在欲望与正义之间的挣扎，以及与宿敌之间的最终对决。